2118년 2월.
공안국 총괄 감시관으로 회의에 참석하던 츠네모리 아카네에게
외국 선박에서 사건이 일어났다는 연락이 들어온다.
아카네는 현장으로 급행하나 왜인지 수사권은 외무성 행동과에 위임되어 있었다.
선박에서는 밀리시아 스트론스카야 박사가 숨진 채 발견되고
사건의 배후에는, 행동과가 계속 쫓고 있던 '피스 브레이커'가 있었다.

박사가 확립한 연구인 통칭 '스트론스카야 문서'를 노린 '피스 브레이커'가 일으킨
사건이란 것을 안 형사과 1계는 행동과와 공동 수사로서 팀을 편성한다.
그곳에는, 일찍이 공안국으로부터 도주한 코가미 신야의 모습이 있었다.

'스트론스카야 문서'를 둘러싸고 예상을 초월한 큰 사건에 맞서게 되는 아카네와 코가미.
그 앞에는 일본 정부, 시빌라 시스템까지 뒤흔드는 어떤 진실이 숨겨져 있었다.
잃어버린 연결 고리를 잇는 <이야기할 수 없었던 이야기>가, 드디어 밝혀진다.